RNA電泳成像：與DNA分析類似，凝膠成像系統也可用于RNA電泳后的凝膠成像分析。通過觀察RNA片段在凝膠上的遷移情況，可以初步判斷RNA片段的大小和完整性。
RNA定量與定性分析：利用凝膠成像系統和軟件，可以對RNA條帶進行定量和定性分析。通過測量條帶的光密度和比較不同RNA樣品的遷移率，可以評估RNA的表達水平和差異。